异染色质是指间期细胞核中（异染色质）

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常染色质易被碱性染料染成浅色，或对福尔根反应呈弱阳性。异染色质易被碱性染料染成深色，或对福尔根反应呈阳性。

异染色质着色较深，常位于细胞核的边缘和核仁周围，构成核仁相随染色质的一部分。可以分为结构性异染色质（constitutive heterochromatin）和兼性异染色质（facultative heterochromatin）两种。

1.结构性异染色质 是各类细胞的整个发育过程中都处于凝集状态的染色质。 此类染色质多位于染色体的着丝粒区，端粒区，次缢痕，以及Y染色体长臂远端2/3区段，含有高度重复的DNA序列，没有转录活性，是异染色质的主要类型。

2.兼性异染色质 是在特定细胞的某一发育阶段由原来的常染色质失去转录活性，转变成凝缩状态的异染色质，二者的转化可能与基因的表达调控有关。例如，女性体细胞中的两条X染色体在胚胎发育早期都是有活性的常染色质，约在胚胎发育的第16天，其中一条x染色质失去活性转变成异染色质，在核膜内缘形成高度凝聚的浓染色小体，及x染色质。

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